动物全物种基因组测序“顾此失彼”

来源： 中国科学报

近日，美国华盛顿州立大学领导的一项研究发现，目前对动物基因组进行的测序多数集中在与人类相似的动物上。研究人员警告称，这会使人们忽视生物多样性和错失机会。相关成果发表于美国《国家科学院院刊》。

研究人员分析发现，近3300种动物的基因组已被测序。然而，与世界上166万种动物物种相比，这一数字还是很少，脊椎动物在目前的序列中占了绝大部分。数据显示，尽管脊椎动物只代表了3.9%的动物物种，但却占测序数据集的54%。相比之下，代表78.5%物种的节肢动物门无脊椎动物，只占当前数据集的34%。

“随着基因组数据集的迅速积累，我们会发现，目前数据集并不是均匀分布在动物生命树中。”研究作者、华盛顿州立大学博士后研究员Scott Hotaling认为，无脊椎动物仍然非常缺乏相关研究，因为人们似乎更关心脊椎动物。

研究通讯作者、美国杨百翰大学助理教授Paul Frandsen表示，要了解整个生态系统，必须对更多的生物进行采样。脊椎动物是生态系统的重要组成部分，但昆虫和许多其他小型生物可能发挥着更重要的作用，因为它们处于食物链的底端。

研究作者、华盛顿州立大学副教授Joanna Kelley还指出，目前绝大多数基因测序工作在发达国家开展，且大多数国家位于北半球，不同地区的测序工作也有特定的倾向。例如，北美国家对哺乳动物和昆虫进行了较多测序，欧洲国家、亚洲国家分别对鱼类和鸟类进行了较多测序。

近年来，几项大型的基因组测序工作启动，其中包括地球生物基因组计划。该计划设定了一个雄心勃勃的目标，在未来10年内对所有真核生物进行测序。

截至2021年6月，该计划已收集到3300多个动物基因组数据集。研究人员通过计算发现，以目前每天大约测序4个基因组的速度，要到3130年才能实现对所有真核生物进行测序的目标。

研究人员同时提出，促进该目标实现的一个方法是发展基础设施，并让更多来自南半球的国家，尤其是动物多样性丰富的热带地区的研究人员参与其中。（辛雨）

相关论文信息：

https://doi.org/10.1073/pnas.2109019118

标签： 基因组测序 生物多样性

为您推荐

精彩放送

精彩图片

热文